Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms