Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHD4Q14839 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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