Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM25Q14258 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms