Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms