Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
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