Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CUL3Q13618 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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