Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPM6BQ13491 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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