Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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