Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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