Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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