Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SREBF2Q12772 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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