Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms