Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms