Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms