Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LTBQ06643 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LTBQ06643 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBQ06643 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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