Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms