Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBXN1Q04323 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms