Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RELAQ04206 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RELAQ04206 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RELAQ04206 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms