Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms