Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DEFA6Q01524 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms