Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF9Q00978 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF9Q00978 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms