Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PITPNAQ00169 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms