Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVK-21P61565 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms