Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNAP25P60880 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms