Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHB3P54753 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB3P54753 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2564.7 ms