Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNA2P51530 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DNA2P51530 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DNA2P51530 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DNA2P51530 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNA2P51530 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNA2P51530 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNA2P51530 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNA2P51530 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNA2P51530 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms