Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF6P49848 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF6P49848 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF6P49848 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TAF6P49848 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms