Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms