Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPIAP49247 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RPIAP49247 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms