Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGP37231 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms