Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms