Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms