Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RYKP34925 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYKP34925 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYKP34925 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYKP34925 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYKP34925 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYKP34925 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYKP34925 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYKP34925 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms