Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMPK1P30085 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMPK1P30085 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms