Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA6P23229 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms