Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GM2AP17900 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GM2AP17900 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GM2AP17900 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GM2AP17900 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms