Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RLBP1P12271 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms