Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMC1P11047 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms