Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN9O95484 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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