Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAPGEF3O95398 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms