Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF2O60811 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF2O60811 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF2O60811 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF2O60811 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF2O60811 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF2O60811 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms