Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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LRRTM2O43300 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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