Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNJ2O15056 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms