Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
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