Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms