Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms