Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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