Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX9Q9Y5X1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX9Q9Y5X1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms