Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX10Q9Y5X0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX10Q9Y5X0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms