Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF3C3Q9Y5Q9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms